Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms