Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpd5D6MZJ6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms