Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms