Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms