Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3676D3Z236 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3676D3Z236 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms