Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kif28pD3YXS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms