Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm4950D3YUM8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm4950D3YUM8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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