Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Vmn1r180B9EK86 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r180B9EK86 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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