Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cspp1B2RX88 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms