Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
1700018F24RikB2RW27 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700018F24RikB2RW27 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms