Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt4B2RU40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt4B2RU40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms