Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud4B2RRE7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud4B2RRE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms