Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zbed5B2RPU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zbed5B2RPU8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms