Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1B2KF50 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms