Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NhsB1AV60 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NhsB1AV60 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms