Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trabd2bB1ATG9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trabd2bB1ATG9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trabd2bB1ATG9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trabd2bB1ATG9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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