Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spocd1B1ASB6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spocd1B1ASB6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms