Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prr29B1ARI9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prr29B1ARI9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms