Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf2A3KGV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf2A3KGV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms