Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm6880A3KG45 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6880A3KG45 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms