Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms