Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tubb1A2AQ07 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms