Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtcflA2APF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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