Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syndig1A2ANU3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1A2ANU3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms