Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Shroom2A2ALU4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom2A2ALU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms