Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SetxA2AKX3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms