Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lcn6A2AJB9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lcn6A2AJB9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Lcn6A2AJB9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lcn6A2AJB9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms