Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm12A2AJ77 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm12A2AJ77 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms