Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930447F04RikA2AFR2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930447F04RikA2AFR2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms