Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbbp8nlA2ABX0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp8nlA2ABX0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms