Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prdm2A2A7B5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm2A2A7B5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms