Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smurf2A2A5Z6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms