Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6268A2A3U9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6268A2A3U9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms