Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkd2l1A2A259 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2l1A2A259 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms