Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trav12-2A0N8N6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trav12-2A0N8N6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trav12-2A0N8N6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms