Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms