Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms