Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms