Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms