Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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