Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms