Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TCOF1Q13428 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
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TCOF1Q13428 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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