Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Sh3bp1P55194 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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