Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms