Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Hoxd10P28359 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Hoxd10P28359 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Hoxd10P28359 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Hoxd10P28359 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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