Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc18Q640L5 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Mir219b-201ENSMUST00000198317 65 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc18Q640L5 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms