Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Sox12Q04890 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Sox12Q04890 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Sox12Q04890 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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