Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd11P23813 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms