Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CtcflA2APF3 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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