Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Trim35Q8C006 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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